Если включено, вы будете вынуждены войти в Hudson используя имя пользователя и пароль имеющими роль администратора ("admin") для смены настроек или запуска новой сборки (ищите ссылку "Вход" в правом верхнем углу страницы). Настройка учетных записей пользователей зависит от контейнера, который вы используете для запуска Hudson. (Например, в Tomcat, по-умолчанию, используется файл $TOMCAT_HOME/conf/tomcat-users.xml)

Если вы используете Hudson в локальной сети (или другом "защищенном" окружении), обычно не имеет смысла включать эту опцию, так что каждый разработчик может настраивать свои проекты не отвлекая админа.

Если вы открываете Hudson в Интернет, то вам обязательно нужно включить эту опцию. Hudson запускает различные процессы, поэтому незащищенный Hudson - легкий путь для хакера.

Для получения дополнительной информации о безопасности в Hudson, прочтите этот документ.