Se habilitado, você tem que se logar com um usuário e senha que tenha o papel "admin" antes de mudar a configuração ou executar uma nova construção (procure pelo link "login" no canto superior direito da página). A configuração de contas de usuários é específica para o contêiner web que você está usando. (Por exemplo, no Tomcat, por padrão, ele procura por $TOMCAT_HOME/conf/tomcat-users.xml)

Se você está usando o Hudson em uma intranet (ou outro ambiente "confiável"), é geralmente desejável deixar este checkbox desligado, tal que o desenvolvedor do projeto possa configurar seus próprios projetos sem incomodar você.

Se você está expondo Hudson para a internet, você deve ligar esta opção. O Hudson é quem lança os processos, assim um Hudson inseguro é um caminho certo para ser hackeado.

Para mais informações sobre segurança e Hudson, veja este documento.